Née le 10 juin 1965 de parents architectes, elle passe son diplôme DPLG en 1990 à l’École nationale supérieure d'architecture de Paris-Belleville.
Elle commence sa carrière comme assistante décoratrice avec Wim Wenders sur le film Jusqu'au bout du monde, Michelangelo Antonioni dans Par-delà les nuages1 et Leos Carax, Pola X. Depuis 1996, elle collabore avec entre autres avec Dominik Moll, Cédric Klapisch, Julie Delpy, Valeria Bruni Tedeschi, Robin Campillo, François Ozon, Alain Guiraudie Justine Triet et Jacques Audiard.
Nommée 4 fois aux Césars dans la Catégorie Meilleurs décors pour son travail sur « 120 Battements par minute « de Robin Campillo , « Aline » de Valérie Lemercier , « Les Amandiers » de Valéria Bruni-Tedeschi et « Anatomie d’une chute » de Justine Triet.
Au théâtre, avec Thierry Klifa comme metteur en scène, elle réalise la scénographie de pièces de Marguerite Duras, Joan Didion et Marcel Mithois.
Parallèlement, elle s’est vu confier des scénographies d’expositions, de lancements de parfums pour Lancôme, Kenzo parfum, Armani . Elle a conçue et réalisé Labullekenzo, premier concept store de la marque, ouvert en 2003 dans les anciens locaux de la Samaritaine à Paris
C'est la cousine de l'écrivain, concepteur, publicitaire, blogueur, chroniqueur et scénariste québécois Pascal Henrard.
Elle a été nommée Chevalier de la Légion d'honneur le 14 Juillet 2018 par le Ministère de la Culture.
Emmanuelle Duplay a intégré l'académie des Oscars
